Category Archives: 药物设计软件

FLARE 基于结构的设计软件

FLARE

Flare V2是Flare的最新版本,一款开创性的基于结构的药物设计软件。Flare V2包含了:1)蛋白结构准备;2)蛋白静电相互作用势分析;3)静电互补性打分;4)WaterSwap结合自由能计算;4)3D-RISM水分子的位置值与稳定性计算;5)分子对接;6)Pyhton API任务自动化与自定义工作流。

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OpenEye Feature

OpenEye–药物发现与设计平台

OpenEye软件是一个药物发现与设计平台,为大规模的药物设计与分子模拟应用而开发。它不仅具有严格的科学意义、还兼顾计算速度、可拓展性以及平台可用性。OpenEye药物设计软件聚焦于先导物识别与优化, 尤其擅长于化学信息学、构象生成、分子对接、形状比较,静电计算与比较,x-衍射晶体学,分子可视化以及数据分析。OpenEye软件支持多CPU/多核心计算,支持Linux,Windows与Mac OS X。OpenEye软件授权灵活,主要目的是最大的释放您的计算能力,指定用户的site license让您可以在任意的机器、不限数量机器上计算您的作业。

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Blaze

Blaze

Blaze用已知配体的形状和静电特性快速地从大型化合物数据中搜寻到具有相似性质的化合物。Blaze擅长于从已知活性化合物发现全新先导样化合物、替换多肽为非肽类化合物、或者替换甾体为非甾体化合物。使用Blaze,可以增加您的项目中先导化合物的结构多样性,并且跃迁到新的化学空间,实质性地改善苗头化合物的性质。

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SPARK

Spark

Spark能为您的项目产生具有结构多样性的全新化合物。它适于合成/药物化学以及计算化学科研人员使用。利用Cresset的场技术寻找分子中关键部分的生物等排替换,让您在新的化学空间中寻找到新的结构。它可优化您的先导化合物,改善知识产权定位;还用它来帮助您在保留活性并减少ADME与毒性问题的同时实现完全转变骨架。

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ligandscout

LigandScout

LigandScout是Inte:Ligand公司的旗舰产品,一款集3D-药效团模型识别、虚拟筛选、精确虚拟筛选的集成平台。支持基于配体或基于结构的药效团建模;高性能叠合算法与构象搜索技术,其具有前所未有的筛选速度与高品质预测质量。提供了筛选分析工具、ROC曲线绘制、分子对接等功能。

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