CONFLEX: 高性能构象分析

CONFLEX 8B

CONFLEX产品概述

CONFLEX®9.B是CONFLEX软件的最新版本,可以快速、准确地自动进行构象搜索和分析。CONFLEX 9的独特之处在于它的构象搜索能力,通过对柔性分子构象空间进行穷举搜索,它能找到每一个有化学意义的构象。CONFLEX 9还用于预测振动频率、热力学性质、CD/UV/Vis光谱以及3JHH NMR耦合常数。

CONFLEX能帮助您做什么事?

绝大部分计算都需从高质量的化合物3D结构出发,比如立体化学确证用到的圆二色谱VCD与ECD计算、核磁(NMR)计算。不同的构象获得的图谱可能不一样,因此对化合物进行构象搜索是非常重要的。

CONFLEX让您能够实现:

  • 结构优化
  • 构象分析,获得低能构象集
  • 晶体结构预测
  • 主客体构象搜索
  • 多聚体构象搜索
  • 与Gaussian、PSI4、NWChem、Turbomole、AMS等常用的量子化学计算软件结合计算NMR、Ramman、CD/UV-Vis等光谱
  • 计算3JHH耦合常数
  • 作为客户端,向LSF或SGE服务器提交Gaussian作业

CONFLEX用于几何优化

CONFLEX在进行几何优化之后会自动进行简正模式分析,并且预测热力学性质,如吉布斯自由能。在几何优化过程中,CONFLEX还可对结构进行部分约束。

CONFLEX用于构象分析

使用以下独特的策略,CONFLEX 8对构象空间进行穷举搜索以发现最为稳定的构象:

  • 逐步微扰
  • 三种模拟热振动的微扰模型:
    • 逐步键旋转
    • 边翻转
    • 角翻转
  • 多种可选力场
  • 可定义搜索限制

CONFLEX会一步到位的给出低能构象集以及每个构象的分布,这些构象可进一步用Gaussian、PSI4、NWchem、Turbomole以及AMS等常见计算量化计算软件计算NMR、Ramman、ECD,VCD等光谱。

CONFLEX用于晶体结构预测

CONFLEX 8能自动产生和优化分子晶体结构,能量最低的结构可按能量或与准备好的粉末图谱数据的相似度进行排序。CONFLEX 7还可以对晶体结构进行粉末衍射计算。

溶剂效应

化学反应、生物学过程以及化合物的物理测量通常在特定的溶液中进行,因此溶剂效应不可忽略。CONFLEX采用GB/SA溶剂模型来进行构象优化、简正模式分析和构象搜索以及LogP计算。

CD/UV/Vis光谱分析

CONFLEX还可预测UV/CD/Vis光谱。更优选的策略是:采用CONFLEX进行构象分析,采用Gaussian进行CD/UV/Vis光盘计算。我们提供CONFLEX+Gaussian完整的解决方案为大家解决ECD,VCD计算问题,因为CED与VCD是构象敏感的计算,所以,正确的构象非常重要 。

CONFLEX protocol 600x454

产品型号

功能 CONFLEX 9 Basis CONFLEX9 Pro
Geometry optimization
Conformation search
Crystal search
Crystal surface
Gaussian interface
DRC
Host-Ligand
Solvent
CD/UV/Vis
Parameter

四种授权方式

授权方式 Single Machine Site License
Single-Core version
Parallel version

无论是CONFLEX 9 Basic还是Pro,均有四种授权方式,其授权有效期为50年。其中Single-core指单核心计算;Parallel指单机多核心并行计算;Single Machine指单机版安装;Site License指授权地址上不限数量安装。

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