Activity miner——发现、理解SAR中的活性与选择性悬崖

给你一个清晰的活性变化理论依据,并在后续的药物设计迭代中为您提供如何利用这个知识的灵感

Flare的Activity Miner组件让你能够快速的了解复杂的构效关系,突出关键的活性变化。专用的界面让你可以详细研究活性悬崖与相邻分子以增加理解。使用它可以用来比较选定分子的静电、形状或蛋白相互作用的变化,或使用3D、2D关系进行聚类。使用Activity Miner模块您将可以:

  • 快速探索构效关系,哪怕在一个庞大的数据库中
  • 用活性悬崖分析寻找关键的活性区域
  • 理解引起活性或选择性变化的形状和静电变化
  • 了解新化合物是如何与整个项目历史联系起来,发现可能会被遗漏的关系
  • 根据您在Activity Miner中获得的见解自信地设计新化合物

SAR的多个视图以获得最大的洞察力

Activity Miner

Activity Miner解释了活动变化背后的原因。它提供了多种数据视图,可帮助您找到SAR中的关键分子对。对于每一对,Activity Miner都会向您展示静电和形状特性的不同之处,从而帮助您了解如何设计具有更好特性的化合物。 不同的视图使您能够专注于SAR 的不同方面。

差值矩阵(Disparity Matrix)

活性悬崖-矩阵视图

差值矩阵是所有分子对的可排序表,显示每个化合物与所有其他化合物的比较情况。

  • 浓郁的颜色对应于较大的活性差异,因此很容易识别出活性的下降或增加
  • 选择一个单元格以在3D窗口中显示一对化合物,可以在其中探索静电和形状的异同
  • 使用多个活性扩展矩阵以突出显示关键的靶标选择性信息
  • 对矩阵进行过滤和排序以找到最相似的分子对

围绕一个化合物探索其SAR

活性悬崖视图2

创新的活动视图(Activity View)将近邻分析与活动悬崖数据相结合,用活性变化对局部SAR进行着色。

  • 选择一个感兴趣的化合物并与其近邻进行比较、查看活性、选择性、相似性和差异性。
  • 在视图中突出显示结构差异,轻松查看您已经对化合物进行了什么样的改变
  • 选择任何邻居以在3D窗口中更详细地检查静电和形状差异
  • 双击一个邻居使其成为新的焦点分子并将其与最近的邻居进行比较

发现最显著的变化

活性悬崖Top视图

Top pair表突出显示了 SAR中的关键点。 它显示了相对于结构变化而言活性变化最大的分子对,使您能够了解对您的项目影响最大的变化。

  • 找到重要分子对,并用高亮显示其结构上的变化
  • 查看每对分子的活性和物理化学性质的关键变化
  • 收藏分子对以便进一步分析
  • 理解每个变化的3D静电与形状差异

将相似的化合物聚合在一起

活性悬崖聚类

使用基于3D或2D相似性的聚类分析,聚类视图(Cluster View)可以轻松查看化合物之间的相互关系。聚类视图

  • 深入了解数据集的化学多样性
  • 横跨多个结构类别可视化活性分布以识别同系物子集和重要的异常值
  • 根据聚类成员标记分子或导出分子
  • 在Flare中显示任何聚类子集以供进一步分析
  • 选择任意合物以在2D和3D中显示活性和结构
  • 用任意性质或数值对表单进行排序

案例研究



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