FieldTemplater

即使在没有靶标结构的情况下,了解活性分子的3D形状及其关系,以及它们如何参与结合

FieldTemplater是Flare的一个组件,它从几个已知活性配体的2D结构开始生成一系列构象,配体在生理条件下可能采用这些构象。分析这些构象以找到分子场相似性高的集合,因此具有相似的形状/结合特性。当所有活性配体都叠合良好时,这时配体的构象很可能是生物活性构象。集合中配体的相似性与差异性提供了活性配体如何与共同的活性位点结合的见解。

用FieldTemplater可以帮助您

  • 了解化合物与其蛋白靶标结合时的形状(生物活性构象)
  • 了解每个系列的不同片段对生物活性和脱靶效应的贡献
  • 深入了解系列化合物的差异之处,如何比较以及如何微调以优化性质
  • 准备详细的场药效团以用于虚拟筛选、生物等排体替换或先导化合物优化
  • 无需靶标结构即可从两三个活性化合物中确定其最佳结合模型。

在GPCR、离子通道和新靶标等靶标结构缺乏的情况下,FieldTemplater 是重建配体生物活性构象的最佳方法,提供简单易懂的结果。

FieldTemplater结果

在没有蛋白X衍射数据的情况下使用分子的静电和形状特征生成生物活性构象假设

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