2D相互作用图——总结蛋白配体相互作用

使用Flare中的相互作用图补充3D窗口中配体-蛋白质接触的可视化,从而以2D方式创建有利的配体-蛋白相互作用和空间冲突的清晰图。

复杂的3D接触网络可以概括为清晰的交互式2D图。在相互作用图中,与配体相互作用的每个残基、水分子或辅因子都由一个彩色圆圈表示,报告残基的三字母代码和链号,例如,PHE A494或 GLU B427。

2D图是交互式的,您可以选择想要显示的接触类型,例如隐藏或显示疏水接触,同时在2D图中单击残基也相应地会在3D窗口中选中它。 2D-Interaction Map

上图显示的2D相互作用图很好地总结了化合物15与TRL8靶标 (PDB 7R53) 形成的配体-蛋白相互作用复杂网络

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