Hit Expander

一种快速评估并逐步完成苗头到先导流程的新方法,湿化学费用最少

Hit Expander是Flare的一个模块,它通过在苗头化合物或先到化合物所有未取代位置上添加小的取代基,使用户能够围绕单个苗头化合物或先导化合物进行快速探索。 从起始结构开始,Hit Expander自动生成变体,包括非常小和受限的结构变化。这些变体可以进一步用短时长模拟的相对结合自由能计算来快速分类,以获得在哪个位置进行取代时可提高活性以及什么类型的取代对活性有利的指导。

Hit Expander生成结构可以用短时长模拟的FEP进行快速排序、分类

图1. Hit Expander自动结构生成与短时长模拟的FEP联用,快速地对化合物进行排序、分类

此外,还可以使用QSAR模型、静电互补性分析(Electrostatic Complementarity™) 或目视检查来评估Hit Expander的结果。

  • 探索整个起始结构,或只对选定的部分进行探索
  • 从常用化学基团列表中选择的小取代基
  • 对芳香族进行合理的单原子取代
  • 将所有变体保存到一个单独的角色中以保持项目整洁
  • 用短时长模拟的FEP计算、QSAR模型或静电互补对变体进行分类

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