一,GAUSSIAN采购前须知

1,学术版还是商业版?

如果您所属的单位大学具有给学生授予学位的资质,那么您可以购买学术版;否则需购买商业版本。当然,即使你是属于学术单位,如果用于商业用途还是需要购买商业版。最终以GAUSSIAN公司的认定为准。

商业版产品报价:http://www.gaussian.com/g_prod/prix/comm_china.pdf

学术版产品报价:http://www.gaussian.com/g_prod/prix/acad_china.pdf

2,GAUSSIAN 09的Single machine/Computer与Site license

Single machine/Computer是指该软件授权书只支持安装在一台机器上(仅允许安装在一台机器上);site license允许在无数台同一型号操作系统或机型(Machine type)上安装。假如您购买了Linux版的Site License,您还希望能在Windows下使用Gaussian,那么您还需要购买一个新的机型,既是Windows版。但是增加第二种机型的时候, 价格也便宜了很多。

3,Machine type(机型)与计算平台

一台计算机可能使用了不同的操作系统、不同供应商的CPU,使用同样的操作系统与CPU的机器为同样的机型(Machine type),适用于某一种机型的GUASSIAN不能在另一种机型上使用。比如在苹果公司的Mac OS X运行的GAUSSIAN不能在WINDOWS操作系统的机器上使用,实际上,不只是GAUSSIAN,全部的软件基本如此。再比如,我们熟悉的操作系统 WINDOWS 8,可以支持ARM与x86两种CPU,但是它们的软件不可通用。所以购买GAUSSIAN之前需要先确定够买什么样机型的GAUSSIAN。

即使是同一个操作系统,不同机型的程序也可能不同通用:比如SSE4.2激活版Gaussian与没有激活版的Gaussian,可能就不能通用。如果你的CPU不支持SSE4.2,那么SSE4.2激活版的Gaussian不可以在该硬件的机器上使用。相反,没有激活SSE4.2的Gaussian既可以在支持SSE4.2的操作系统下使用,也可以在那些不支持SSE4.2的操纵系统下使用。

注:SSE4.2激活的Gaussian在性能上会比对应的没有激活的版本会高出5-25%, 注意,不是所有的计算都有性能上的提高。

更多详细的信息,请参阅GAUSSIAN公司网站,支持的平台部分(Support platform):http://www.gaussian.com/g_prod/g09.htm

4,并行计算

并型有两种方式,单机并行计算(单机多CPU或多核并行)与跨节点并行计算(或者说局域网内并行计算)。如果需要单机并行计算,则需要购买 Mutiprocessor版;如果还需要跨节点并行计算,则还需要购买TCP Linda。跨节点并行适于在高性能集群里使用或者多台单机通过局域网连接实现多台机器之间跨节点并行计算。

5,GaussView 5 与 Gaussian 09

GaussianView 5(GV5)可以用来搭建分子、建立作业脚本以及分析计算结果。GV5与Gaussian安装在同一个机器上与分别安装在不同的机器上价格有差别,所以在 购买前需要考虑到这一个因素。比如,将GAUSSIAN安装在计算中心,而GaussView安装在本地的Windows机器上,使用的时候通过 GaussView生成作业脚本再通过网络提交到计算中心,获得结果后在本地的机器上进行分析。这时候,您的G09与GV5就不是安装在同一个机器上。

6,32bit版本还是64bit版本

取决于操作系统与CPU硬件,假如您的CPU支持64bit而安装的操作系统是32bit,那么你的机器还是32bit。在WINDOWS平台下,32bit 机器有很多限制,比如无论您的实际内存有多大、硬盘有多大,但是该系统最多能使用2GB的内存与16GB的硬盘,其单机多核并行也最多能用到4个处理核心 (核)。如果您的机器有12核,建议您安装WINDOWS操作系统的时候选择64bit版本,GAUSSIAN也选择64bit,这样可以让您的硬件充分 发挥其应有的性能。

关于WIDNOWS平台32bit与64bit软件地更多信息,请查阅原厂提供地资料:

http://www.gaussian.com/g_prod/g09w.htm

7,我是WINDOWS的用户,请给我推荐一个配置

请参阅GAUSSIAN公司官网上推荐的最低配置要求:http://www.gaussian.com/g_prod/g09w.htm

8,采购GAUSSIAN,如何才能“便宜”些?

一般情况下,很多大学都有进口免税的资质,请咨询您的设备科或主管部门就知道了。如果具有进口免税的资质,您可以通过当地的进出口公司为你们代理进 出口业务,这样您会以最优的价格购买GAUSSIAN。如果您由于种种原因不能以申请进口免税的方式采购而只能采用人民币报价,由于存在税收、海关处理等 的费用,人民币报价相对免税的美金报价要高,请大家谅解。

二、关于LigandScout

1,Ligandscout

LigandScout可以建立基于配体的药效团、基于结构的药效团;Ligandscout还可以用来进行基于药效团的虚拟筛选;同时 Ligandscout生成的药效团可以直接导出给OpenEye FRED, Schrodinger Phase, MOE, Discovery Studio Catalyst进行虚拟筛选。

2,PharmacophoreDB

Inteligand的药效团数据库收集几百个疾病的靶点药效团模型,可以用来进行靶点预测或者药物作用谱分析。可以帮您预见化合物可能的生物学活性、作用靶点、副作用等。

3,ilib diverse

ilib diverse是虚拟化合物库设计软件:根据您的定义设计结构多样的化合物数据库,可以用来进一步进行虚拟筛选。

更多问题,请与我们联系:info@molcalx.com