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Ilib Diverse: 生成高质量的化合物库

Ilib Diverse简介

ilib diverse是Inte:Ligand公司推出的一款高质量的虚拟化合物库设计软件,可以帮助科研人员设计多样、高质量的虚拟化学物库。

ilib diverse有很多的特性使得不同于其它药物设计软件,这些特性包括:

优质的内容

ilib diverse包含有一个详细定制的化合物片段数据库,该数据库适于生成类药分子与集中库采样(请预览免费的样品数据库

先进、高级的过滤性能

ilib diverse包含有几套预先定义号的过滤子,包括:

口服生物利用度(Veber, Fichert, Lipiski rule of 5, Palm)

BBB透过性(Murcko, Van de Waterbeemd)

类药性 (Ghose, Lee, Mozziconacci, Oprea, Walters & Murcko)

类先导性(Oprea)

支持用下列性质自定义过滤子,包括:

原子数、重原子数、芳香性原子数

分子量

柔性键数量

环的数量

计算的油水分配系数(logP)

拓扑极性表面积(TPSA)

氢键供体、受体数

正、负离子化区数量

N,O,卤素原子数

图形用户界面

ilib diverse具有非常易用的图形界面,容易学习、上手快。没有任何药物设计的实验工作人员可以快速完成药物设计过程。

用CORINA生成3D结构

与Molecular Networks的3D结构生成器CORINA无缝整合,用户可以配选CORINA。

快速

在一台标准PC机上,根据不同的过滤子使用情况,每分钟可以使生成15000个化合物结构

灵活

化合物片段与过滤子的设置可以完全自主定义并保存包括概率权重与组合条件限制等。

开放

可以导出设计化合物库为SMILES或SDF文件格式,生成的分子可以给目前绝大部分的药物设计软件进一步使用。

参考文献

[1] G. Wolber and T. Langer. CombiGen: A novel software package for the rapid generation of virtual combinatorial libraries. In H.-D. Höltje and W. Sippl, editors, Rational approaches to drug design, pp 390-399. Prous Science, 2000.

[2] J. Sadowski and H. Kubinyi. A Scoring Scheme for Discriminating between Drugs and Nondrugs. J. Med. Chem.; 1998; 41(18) pp 3325 – 3329).

[3]  Bretonnet, A.-S.; Jochum, A.; Walker, O.; Krimm, I.; Goekjian, P.; Marcillat, O.; Lancelin, J.-M.; NMR Screening Applied to the Fragment-Based Generation of Inhibitors of Creatine Kinase Exploiting a New Interaction Proximate to the ATP Binding SiteJ. Med. Chem.; 2007; 50(8); 1865-1875.
DOI: 10.1021/jm061460r

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Inte:ligand网站:http://www.inteligand.com

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