化学信息学在线免费资源主要给大家介绍一些常用的化学信息学在线免费资源。

1,小分子数据库

小分子数据库可以用来进行虚拟筛选等,推荐ZINC不仅因为全、而且准备的非常好。包含了来自全世界各地化学品供应商的实体化合物库,已经准备好虚拟筛选直接可以使用的mol2,sdf等格式。

网址:http://zinc.docking.org

 

2, Decoy生成

虚拟筛选的方法验证离不开decoy生成,DecoyFinder是免费的decoy生成器。

网址:http://urvnutrigenomica-ctns.github.io/DecoyFinder

 

3,Openbabel:格式转化与化学信息学

openbabel支持大部分化学结构的格式转化,比如将mol2文件转化为sdf文件,mol2转为为Gaussian09,MOPAC的输入文件。还支持指纹图谱计算。

网址:http://www.openbabel.org

 

4, 中药数据库

中药数据库TCM@Taiwan (http://tcm.cmu.edu.tw),包含了常用中药中的化合物,按疾病与植物进行了分类。

可以直接从ZINC数据库下载,用于虚拟筛选。

下载地址:http://zinc.docking.org/catalogs/tcmnp