XedTools

XEDTOOLS

XEDTOOLS™

让你可以使用Cresset XED力场的命令行工具

产品概述

XedTools (包含XedeX 与 XedMin)提供了迄今最具创新的分子力学力场。XED用偏心原子电荷模型于电负性原子上以精确地模拟原子周围的电荷密度,这使得分子间相互作用的描述得以改善。XedTolls目前包含构象生成与配体能量最小化两主要功能。

为什么使用XedTools

XedeX

XedeX是一个使用我们独有的XED力场的力场构象探索工具。它用来在少量构象中产生各种各样的能量优化配体构象。XedeX的性能是超常的,大多数类药配体在100个构象内重现了配体的活性构象。使用XedeX能给您:

  • 多样性构象分布
  • 能量可及的和真实的构象分布
  • 极好地控制您的构象生成实验
  • 在XED力场中充分优化构象

XedMin

XedMin使用XED力场优化配体。使用XedMin能给您:

  • 准确的、实验上有效的分子间相互作用
  • 正确优化pi-pi相互作用
  • 正确预测阳离子-pi相互作用
  • 各向异性电荷和极化性
  • 改进的分子静电

产品特性

特性 XedMin XedeX
全功能的能量优化器
高性能的配体构象生成器,生成充分优化的构象
使用Cresse专有的XED力场
支持Windows与Linux操作系统
可编写脚本的命令行界面,使用灵活
KNIME界面,可整合到其它工作流中
Pipeline Pilot界面,可整合到其它工作流中
academic bursary program
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