Activity Miner

Activity Miner概述

Activity Miner让你能够快速的了解复杂的构效关系，突出关键的活性变化。重要的是，Activity Miner给你一个清晰的活性变化理论依据，并在后续的药物设计循环中为您提供如何利用这个知识的灵感。Activity Miner将“Disparity”或“activity Cliff”概念用到SAR中的突出部分，在这里你可以观察到最重要的变化。一对分子的差异（disparity）用其活性差值除以它们之间的空间距离的值来表示。传统上，一对分子间的空间距离用圆形指纹图等2D相似性来定义。在Activity Miner中您不仅可以使用这个2D标准，而且您还能从Cresset的新科学中获益，比如使用3D形状加静电相似度来定义一对分子间的距离。这个新技术让我们能够发现SAR中使用其他方法会遗漏的重要变化。最重要的是，它给出隐含在活性变化之后的原因，这对于设计新的和更好的化合物来说是至关重要的信息。

为什么选择Activity Miner

使用Activity Miner模块您将可以：

• 快速浏览构效关系中，哪怕在一个庞大的数据库中
• 寻找关键的活性区域和探索单一化合物周围的空间
• 理解引起活性变化的形状和静电变化
• 看看新化合物是如何与整个项目历史联系起来，寻找那些使用其他方法可能会遗漏的关系
• 发展您将用于设计新化合物的对SAR的关键见解

多种SAR视图方式

Activity Miner专注于解释活性变化背后的原因。它提供了数据的多个视图，以帮助您在SAR中找到关键的分子对。对于每一对分子，Activity Miner向您展示了静电和形状属性是如何不同的，从而帮助您了解如何设计具有更好属性的更好化合物。不同的视图使您能够专注于SAR的不同方面。

观察全部数据

活性悬崖矩阵是一种可排序的分子对表单，展示了一个分子与所有其它分子之间的比较结果：

• 颜色越浓则悬崖越大，很容易发现活性的增强与降低
• 选择一个单元格可以在3D视窗中展示一对分子，可以用形状与静电探索一对分子兼职的相似性与差异
• 将矩阵扩展到多种活性可以突出关键的选择性信息
• 对矩阵进行过滤、排序以发现最相似的分子对

探索一个化合物周围的构效关系

创新的活性视图结合了近邻分析和活性悬崖数据，将局部SAR用活性变化来着色。

• 选择一个感兴趣的化合物与其邻近化合物进行比较，观察活性、选择性、相似性与差异性
• 视图突出显示了结构差异，使您更容易看到已经做了哪些更改
• 选择任意一个邻居在3D窗口中更详细地检查静电和形状差异
• 双击一个邻居使其变为新的中心分子并与其最近的邻居进行比较

发现最显著的变化

Top pairs表突出显示了SAR中的关键点。它显示了相对于结构变化表现出最大活性变化的分子对，使你能够理解对项目影响最大的变化。通过该表可以：

• 发现重要的分子对及其结构变化
• 观察每一对分子间关键活性与理化性质变化
• 收藏分子对以便进一步分析
• 在3D视窗中分析静电与形状的变化
• 根据性质的值对表排序

将相似的化合物聚合在一起

通过基于3D或2D相似性的聚类分析，使您更容易看到化合物如何相互关联。

• 洞察数据集的化学多样性
• 观察不同簇的活性变化可以找出同系物与离群分子
• 根据聚类的成员对分子加标签(tag)或导出分子
• 在Forge中展示任意的类以便进一步分析
• 支持选择任意化合物以展示活性以及2D或3D结构

特色

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