Flare FEP

健壮、高效的计算

  • 无缝的准备蛋白与配体
  • 用Flare的配体叠合工具可以轻松的将化合物叠合好,或者用Flare的分子对接可以轻松的将配体叠合到FEP项目相关的蛋白结合位点里
  • 无缝的准备蛋白与配体
  • 全自动、高效地创建FEP网络,提供选项优化映射
  • 在专用的视窗中轻松地查看结果、问题排除、识别有问题的转化
  • 用预测的活性对配体进行可视化分析、排序与优先性排序

精确的FEP计算

  • 对一系列结构紧密相关的配体(或同系物)用炼金术法精确地计算相对结合自由能(参见J. Chem. Inf. Model. 2020, 60(6):3120–3130)
  • 在Flare FEP计算中使用完全连接的双向网络可获得精确度,从而可以更准确地估计每个链接的误差并彻底分析循环误差。
  • 通过中间体的自动添加可以更好地链接结构相关的配体,轻松生成网络图
  • 全自动、高效地创建FEP网络,提供选项优化映射
  • 在专用的视窗中轻松地查看结果、问题排除、识别有问题的转化
  • 用预测的活性对配体进行可视化分析、排序与优先性排序

自由能循环

自由能循环

快速的FEP计算

  • 将您的 Flare FEP 计算拆分为适合您 GPU 资源的最佳包大小,从而在短短 30 分钟内预测单个化合物
  • Flare FEP的模拟计算使用了先进的积分器、氢质量重新分配和优化的水盒形状和尺寸
  • 通过使用Cresset Engine Broker连接到本地集群或云计算设施来优化计算时间
  • 由软件自适应地自动确定每个微扰之间λ 窗口数量的分配,实现量身定制、更快速的模拟

Flare FEP calculations are 2-3.5 times faster in Flare V5 compared to Flare V4

比之Flare V4, Flare V5的FEP计算速度提高了2-3倍