配体叠合

比较同系物、多样的活性化合物以理解SAR、构建模型与药效团

无论是使用静电还是子结构叠合配体,现有的SAR都将决定您对结果的看法。 Flare提供了多种方法来使叠合偏向于您在项目中拥有的现有知识。

  • 选择使用场约束来强制基于静电的叠合。
  • 选择药效团约束以强制具有特定官能团的相互作用。
  • 在叠合时使用蛋白结构作为排除体积。

可靠的多配体叠合

Flare为您提供多配体叠合的可靠工具。Cresset专利的配体比较方法,可对分子进行叠合和打分,为活性配体生成潜在的生物活性构象;并在虚拟筛选、骨架跃迁和药效团识别等方面拥有良好的记录。 子结构叠合的结果还可以作为QSAR模型构建或FEP计算的输入。灵活选项和多种使用方法可以让您使用已知的SAR来影响结果,以便在人为干预最少的情况下获得可以信任的结果。

多配体叠合

洞察结构的相似性:将您的系列化合物与已知的抑制剂比较

使用配体的静电和形状特性可以比较结合到同一活性位点的多样分子,让您深入了解您的系列化合物与其他已知抑制剂的相似之处。我们基于场的叠合和打分方法是成功的大规模虚拟筛选方法BLAZE与 骨架跃迁方法SPARK的计算引擎。在 Flare 中,用它来比较不同系列的配体,实现SAR转化、设计新骨架、或在图形界面中或pyflare命令行进行行中进行小型的虚拟筛选。

化合物场点比较

子结构叠合

Flare 子结构叠合方法使您能够为 SAR 研究生成高质量的输入文件。

  • 将您的所有分子转化为单一文件作为 QSAR或FEP实验的输入。
  • 在单个实验中自动匹配多个参比结构。
  • 通过子结构匹配规则和SMARTS模式来控制叠合。

子结构叠合