Gaussian 09的安装与使用

一、Gaussian 09的安装

以linux为例子,假设使用光盘安装、bash环境下安装、命令行提示符为”>”。

假设安装目录为”dir”, 光盘的目录为/media/cdrom, 计划使用g09的用户组为g09

>export g09root=”dir”

>export mntpnt=/media/cdrom

>cd $g09root

>tar -zvxf $mntpnt/tar/*.tgz

>chgrp -R grp g09

>cd g09

>./bsd/install

二、Gaussian 09的使用

假设g09安装目录为“dir”, G09的Scrath files目录为“sdir”

>export g09root=”dir”

>export GAUSS_SCRDIR=”sdir”

或者将上述两行命令加入到文件$g09root/g09/bsd/g09.profile

每次运行G09前先运行:

>source $g09root/g09/bsd/g09.profile

三、运行一个实例

假设该作业名称为test429.com,结果为test429.log

>$g09root/g09/g09 < test429.com > test429.log

 

*Linda版并行的Gaussian09与普通版Gaussian(共享内存并行)版的安装没有区别。只是在通过HPC计算时因为作业管理系统的原因,在使用上要注意:作业管理系统(比如PBS,LSF,SGE)先获得计算资源,通过内置的变量获得节点名称传递给Gaussian就可以了;而单机共享内存并行不需要考虑节点名称。比如PBS类的作业管理系统,”$PBS_NODEFILE”给出当前作业”$PBS_JOBID”的节点名称,将节点名称赋值给变量GAUSS_WDEF就可以实现跨节点并行。

 

参考资料

Gaussian软件的安装:http://www.gaussian.com/g_tech/install/g09bin.pdf

四、快速入门教程

Gaussian 09 Windows版入门教程:http://www.molcalx.com.cn/wp-content/uploads/2015/01/Gaussian09W_tutorial.pdf

五、寻求技术支持

参见:http://www.molcalx.com.cn/cnhelp