PharmacophoreDB:一种3D靶点药效团数据库

Inte:Ligand的药效团数据库(HypoDB已经可以直接在DiscoveryStudio与PipelinePilot里使用)是一个化合物靶点预测工具,可以从小分子的化学结构出发,全自动、非常方便地推导出药物的作用谱。这使得PharmacophoreDB是老药新用、副作用预测的理想工具。

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Inte:Ligand药效团数据库是一种高质量的三维药效团数据库。由经验丰富的专家历经多年人工建立、收集、逐个严格的质量检验而成。该数据库的模型既有来自蛋白质-配体三维结构复合物还有部分来自生物活性有机小分子结构数据。

目前,该数据库含有2500多个药效团模型,覆盖了300多种临床相关的药治疗靶点,包含了主要的治疗类别,比如如抗感染药、心血管、胃肠道、内分泌、免疫、代谢、神经系统、肿瘤、肾脏-泌尿系统,以及呼吸系统药物。

该数据库目前已经无缝地集成到Catalyst和DiscoveryStudio / PipelinePilot环境中,在Accelrys标准软件产品中进行使用。

相关文献

  • Parallel Screening: A Novel Concept in Pharmacophore Modelling and Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, C. Laggner, T. Langer J. Chem. Inf. Model., 46, 2146-2157 (2006) DOI 10.1021/ci6002043
  • High Throughput Structure-based Pharmacophore Modeling as A Basis for Successful Parallel Virtual Screening T. M. Steindl, D. Schuster, G. Wolber, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des., 20, 703-715 (2006) DOI 10.1007/s10822-006-9066-y
  • Pharmacophore Modeling and Parallel Screening for PPAR Ligands P. Markt, D. Schuster, J. Kirchmair, C. Laggner, T. Langer J. Comput. Aided Mol. Des. 21, 575-590 (2007) DOI 10.1007/s10822-007-9140-0

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