ChemBio3D Ultra 14
一、ChemBio3D Ultra 14简介
ChemBio3D® Ultra 14.0为您奉上工作站级的桌面分子图形软件与计算工具。它与分子分析工具整合，使得ChemBio3D成为化学家与生物学家们的理想工具。
ChemBio3D® Ultra 14.0让您能够探索化学与生物模型的结构。结构浏览器可以展示一系列小分子结构及其性质以便分析与比较。ChemBio3D® Ultra 14.0为桌面提供了便利的搭建、可视化以及计算工具。ChemBio3D可以用于展示分子表面与分子轨道等许多种性质。对于生物大分子，ChemBio3D可以展示蛋白与核酸的cartoon视图。
ChemBio3D® Ultra 14.0包含了ChemBio3D Ultra, ChemDraw Pro, ChemBioFinder Std, 以及 ChemScript等应用. 它还包含了GAMESS，MOPAC, Gaussian, AutoDock以及CONFLEX等用户界面.
图1,ChemBio3D提供了多个应用接口：AutoDock,MMFF94力场,GAUSSIAN 09以及CONFLEX
图2,ChemBio3D提供MMFF94力场应用：可以用来对初始结构优化、进行随机构象搜索
图3,ChemBio3D提供CONFLEX应用界面：可以用来对结构进行高质量的优化、进行穷尽的构象搜索、按Bolzmanns权重对构象排序其结果可以提供给后面的VCD、ECD、NMR以及荧光等计算
图4,ChemBio3D提供Gaussian 09应用界面：已经针对常见需求进行预设好界面，帮助您傻瓜式的完成计算
图5,ChemBio3D提供Property计算：丰富的各种理化性质、热力学性质预测，满足药物设计与分子模拟的大部分需求
二、ChemBio3D Ultra 14.0的亮点
- AutoDock用户界面：柔性的分子对接，观察小分子与大分子的相互作用模式；
- CONFLEX®用户界面：快速优化化合物构象、搜索其构象空间、识别出低能构象集,这些是UV/Vis、ECD、VCD、荧光等计算必不可少的基础；
- Gaussian®用户界面：最流行、经典、可靠的量化计算软件。
三、ChemBio3D Ultra的主要功能模块
| 主要应用 | 功能 |
|---|---|
| ChemScript Pro | 对化学结构进行批处理：多种计算与操作。包括结构取向、基于模板的标准化，脱盐，指纹图谱生成与格式转化 |
| ChemDrwa/Excel Pro | 在Excel里创建化学表单；搭建、操作化学结构；计算化学性质；进行结构与子结构搜索 |
| BioDraw Pro | 除了基本的化学结构画图功能外，还提供化学查询性质、建立与编辑模板与别名，注释，相对立体化学信息、ISIS/Draw兼容，支持多种化学结构文件，提供TCL与Gel电泳模板工具，生物分子画图，ChemProp计算，结构整理，读写各种化学文件格式以及图谱与反应。 |
| ChemBio3D Ultra | 专门为化学家与生物学家设计的分子模拟与蛋白可视化桌面级应用。可以用用来观察3D配体－受体相互作用细节、展示与分析分子表面以及氢键相互作用。让你能在Chemdraw里搭建有机小分子、同时观察3D结构。进行基本的分子模拟计算，比如分子叠合、随机构象分析、MM2与MMFF94力场计算与分子动力学模拟。提供MOPAC，Jaguar、GAMESS与GAUSSIAN的图形界面以便进行从头、半经验计算，NMR、IR与Ramman光谱的预测与可视化。还提供了Autodock界面进行分子对接计算，以及CONFLEX界面进行构象分析。 |
| ChemBioFinder Std | ChemBioFInder是化学结构与信息数据库的管理系统。通过用户自定义的表单可以浏览、建立、搜索、更新数据库的结构、数值与文本，支持进行结构、子结构查询，以及数值以及文本的方式操作，支持结构、子结构搜索。支持不同模式的结构可视化与编辑，自动创建数据库与表单用于导入、导出以及打印数据 |
| ChemBioFinder for Office | 搜索在本地或网络上文档里的化学物结构。识别多种结构格式：cdx, mol, sdf, rxn以及skc。可以展示搜索结果，并导出保存为sdf格式。 |
| GAMESS and GAMESS Pro Interface | 提供GAMESS的图形界面 |
| MOPAC Interface for ChemBio3D | 半经验量化计算软件MOPAC的图形界面 |
| CONFLEX Interface | 高性能构象分析与能量优化软件CONFLEX的图形界面 |
| AutoDock | 分子对接软件AutoDock的图形界面 |
| Gaussian Interface | Gaussian软件图形界面 |
四、ChemBio3D Ultra购买
1,学术版价格
Windows，单机永久版：3888元
2，支付方式
可以线下交易，还可以 ，可以在线支付（支付宝）或银行汇款。
五、互补软件
- CONFLEX：最精确的3D构象优化与搜索软件，与ChemBioOffice无缝整合并提供计算界面；
- GAUSSIAN：最精确、流行与通用的量化计算软件，与ChemBioOffice无缝整合并提供计算界面；
- AutoDock：与ChemBioOffice无缝整合，提供分子对接计算，探讨结合模式;
- 结合位点数据库：广州墨灵格自有的数据库，可以下载靶点直接实现分子对接。
墨灵格式同时也是CONFLEX，GAUSSIAN的中国代理商，同时购买送ECD计算与AutoDock分子对接计算培训教程。
Figure 1,小分子－蛋白结合模式：用ChemBioOffice，AutoDock计算不再有任何难度