ChemBio3D Ultra 14

一、ChemBio3D Ultra 14简介

ChemBio3D® Ultra 14.0为您奉上工作站级的桌面分子图形软件与计算工具。它与分子分析工具整合,使得ChemBio3D成为化学家与生物学家们的理想工具。

ChemBio3D® Ultra 14.0让您能够探索化学与生物模型的结构。结构浏览器可以展示一系列小分子结构及其性质以便分析与比较。ChemBio3D® Ultra 14.0为桌面提供了便利的搭建、可视化以及计算工具。ChemBio3D可以用于展示分子表面与分子轨道等许多种性质。对于生物大分子,ChemBio3D可以展示蛋白与核酸的cartoon视图。

ChemBio3D® Ultra 14.0包含了ChemBio3D Ultra, ChemDraw Pro, ChemBioFinder Std, 以及 ChemScript等应用. 它还包含了GAMESS,MOPAC, Gaussian, AutoDock以及CONFLEX等用户界面.

ChemBio3D Application

图1,ChemBio3D提供了多个应用接口:AutoDock,MMFF94力场,GAUSSIAN 09以及CONFLEX

ChemBio3D MMFF94力场

图2,ChemBio3D提供MMFF94力场应用:可以用来对初始结构优化、进行随机构象搜索

ChemBio3D CONFLEX

图3,ChemBio3D提供CONFLEX应用界面:可以用来对结构进行高质量的优化、进行穷尽的构象搜索、按Bolzmanns权重对构象排序其结果可以提供给后面的VCD、ECD、NMR以及荧光等计算

ChemBio3D Gaussian

图4,ChemBio3D提供Gaussian 09应用界面:已经针对常见需求进行预设好界面,帮助您傻瓜式的完成计算

ChemBio3D Property

图5,ChemBio3D提供Property计算:丰富的各种理化性质、热力学性质预测,满足药物设计与分子模拟的大部分需求

二、ChemBio3D Ultra 14.0的亮点

  1. AutoDock用户界面:柔性的分子对接,观察小分子与大分子的相互作用模式;
  2. CONFLEX®用户界面:快速优化化合物构象、搜索其构象空间、识别出低能构象集,这些是UV/Vis、ECD、VCD、荧光等计算必不可少的基础;
  3. Gaussian®用户界面:最流行、经典、可靠的量化计算软件。

三、ChemBio3D Ultra的主要功能模块

主要应用 功能
ChemScript Pro 对化学结构进行批处理:多种计算与操作。包括结构取向、基于模板的标准化,脱盐,指纹图谱生成与格式转化
ChemDrwa/Excel Pro 在Excel里创建化学表单;搭建、操作化学结构;计算化学性质;进行结构与子结构搜索
BioDraw Pro 除了基本的化学结构画图功能外,还提供化学查询性质、建立与编辑模板与别名,注释,相对立体化学信息、ISIS/Draw兼容,支持多种化学结构文件,提供TCL与Gel电泳模板工具,生物分子画图,ChemProp计算,结构整理,读写各种化学文件格式以及图谱与反应。
ChemBio3D Ultra 专门为化学家与生物学家设计的分子模拟与蛋白可视化桌面级应用。可以用用来观察3D配体-受体相互作用细节、展示与分析分子表面以及氢键相互作用。让你能在Chemdraw里搭建有机小分子、同时观察3D结构。进行基本的分子模拟计算,比如分子叠合、随机构象分析、MM2与MMFF94力场计算与分子动力学模拟。提供MOPAC,Jaguar、GAMESS与GAUSSIAN的图形界面以便进行从头、半经验计算,NMR、IR与Ramman光谱的预测与可视化。还提供了Autodock界面进行分子对接计算,以及CONFLEX界面进行构象分析。
ChemBioFinder Std ChemBioFInder是化学结构与信息数据库的管理系统。通过用户自定义的表单可以浏览、建立、搜索、更新数据库的结构、数值与文本,支持进行结构、子结构查询,以及数值以及文本的方式操作,支持结构、子结构搜索。支持不同模式的结构可视化与编辑,自动创建数据库与表单用于导入、导出以及打印数据
ChemBioFinder for Office 搜索在本地或网络上文档里的化学物结构。识别多种结构格式:cdx, mol, sdf, rxn以及skc。可以展示搜索结果,并导出保存为sdf格式。
GAMESS and GAMESS Pro Interface 提供GAMESS的图形界面
MOPAC Interface for ChemBio3D 半经验量化计算软件MOPAC的图形界面
CONFLEX Interface 高性能构象分析与能量优化软件CONFLEX的图形界面
AutoDock 分子对接软件AutoDock的图形界面
Gaussian Interface Gaussian软件图形界面

四、ChemBio3D Ultra购买

1,学术版价格
Windows,单机永久版:3888元

2,支付方式
可以线下交易,还可以 ,可以在线支付(支付宝)或银行汇款。

五、互补软件

  1. CONFLEX:最精确的3D构象优化与搜索软件,与ChemBioOffice无缝整合并提供计算界面;
  2. GAUSSIAN:最精确、流行与通用的量化计算软件,与ChemBioOffice无缝整合并提供计算界面;
  3. AutoDock:与ChemBioOffice无缝整合,提供分子对接计算,探讨结合模式;
  4. 结合位点数据库:广州墨灵格自有的数据库,可以下载靶点直接实现分子对接。

墨灵格式同时也是CONFLEX,GAUSSIAN的中国代理商,同时购买送ECD计算与AutoDock分子对接计算培训教程。

AutoDock

Figure 1,小分子-蛋白结合模式:用ChemBioOffice,AutoDock计算不再有任何难度

六、AutoDock教程(ChemBio3D版)

七、联系我们

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