一,前言

Me-too,Me-Better的关键之一是设计新化合物,绕开专利保护。通常专利通过化合物骨架或母核等来描述保护范围,我们将这个骨架、侧链等用来定义受保护范围的部分替换成新结构,就可以实现专利突围。

显而易见,这个专利突围的目标是:骨架或侧链进行替换而继续保留活性。利用分子形状与静电相似的分子具有相似的生物学特点,将受保护的结构片段用一个具有同样分子形状与静电性质的新片段代替后,产生的这个新化合物应该极可能还具有原有的活性同时达到避开专利的目的。

Torch就是这样的一个产品,您可以随时改变化合物,同时观察分子的形状与静电变化,最后你可以设计与原有化合物具有同样形状与静电性质而结构完全不同的化合物。

二、药物设计竞赛

在2011年Cresset举办的一次药物分子设计竞赛中,来自Novatis的Peter Ertl与来自VU University Amsterdam的药化研究生Albert Kooistra分别获得第一名与第二名。他们用Cresset的FieldAlign(现在的Torch)设计了如下化合物。

DaM-Winner-Molecules2

这个竞赛中,这两个优胜者分别设计出与原有化合物在专利意义上“截然不同”的结构,但是保留了及其相似的分子形状与静电,这个新化合物极可能还保留有原有的生物学活性。

在靶点的口袋里观察化合物,也展示出相似的相互作用模式,如下图所示。

DaM-Winner-Molecuels-in-Context-of-Protein-1024x335

三、总结

总得来说,在这个竞赛中,优胜者们用Torch (FieldAlign)设计出了形状与静电与原型分子及其相似,但化学结构完全不同的化合物,这些化合物有望保留有原型药物的活性,实现专利突围。

四、联系我们获取试用

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