Flare™ V3正式发布–包含FEP与新的工作流
FLARE V3正式发布,新特性包括可靠、充分验证的自由能微扰(FEP)计算;多种分子对接(Docking)方式,包括共价对接、模板对接,提升性能的Lead Finder分子对接;整合了Forge的基于配体的叠合,可以进行构象搜索、基于场、形状与子结构叠合;还提供了分子动力学模拟以及100多个新功能与改进。
FLARE V3正式发布,新特性包括可靠、充分验证的自由能微扰(FEP)计算;多种分子对接(Docking)方式,包括共价对接、模板对接,提升性能的Lead Finder分子对接;整合了Forge的基于配体的叠合,可以进行构象搜索、基于场、形状与子结构叠合;还提供了分子动力学模拟以及100多个新功能与改进。
本文预告了Flare V3的部分新功能与性能改进。自由能微扰(FEP)计算相对结合自由能是该版本的最大亮点,已经用多种数据完成了内部验证。与Schrodinger的FEP+相比性能相当,而优于AMBER/TI;此外,模板对接(Template Docking)改善了同系物分子对接的性能。
Flare是Cresset的基于结构药物设计软件,在本文中它内置的蛋白相互作用势分析方法用于计算BTK激酶活性位点里精细的静电特征。相互作用势图用于比较几个精选的BTK配体以详尽地了解配体结合的构效关系(SAR)。FLARE里的3D-RISM分析也用来研究了BTK活性位点里结晶水分子的分布稳定性。