Flare FEP
本文介绍了最新发布Flare V5中Flare FEP的特性介绍,包括:不影响准确度的情况下近乎1倍的速度提升;自动的中间体添加;改进的拓扑构造容纳更多的分子;提升的预测性能与准确度;易于使用、易于结果分析。总的来说Flare V5的FEP兼具速度、精度与易用性,极具竞争力。
FLARE V3正式发布,新特性包括可靠、充分验证的自由能微扰(FEP)计算;多种分子对接(Docking)方式,包括共价对接、模板对接,提升性能的Lead Finder分子对接;整合了Forge的基于配体的叠合,可以进行构象搜索、基于场、形状与子结构叠合;还提供了分子动力学模拟以及100多个新功能与改进。
本文预告了Flare V3的部分新功能与性能改进。自由能微扰(FEP)计算相对结合自由能是该版本的最大亮点,已经用多种数据完成了内部验证。与Schrodinger的FEP+相比性能相当,而优于AMBER/TI;此外,模板对接(Template Docking)改善了同系物分子对接的性能。